Depuis son origine, Ingénieurs sans frontières s’est engagé dans des projets de coopération au développement favorisant l’accès à l’eau potable dans les pays du Sud. En effet, un tiers de la population mondiale est privée d’accès à l’eau potable, dont la moitié de la population subsaharienne. La finalité de l’action d'ISF est d’améliorer l’accès à l’eau potable et à l’assainissement  à travers trois objectifs :
- Accompagner la réalisation de projets d’accès à l’eau et à l’assainissement
- Contribuer à interroger et améliorer les pratiques de coopération dans le domaine de l’eau et de l’assainissement ;
- Sensibiliser, informer, et mobiliser sur les problématiques d’accès à l’eau potable et à l’assainissement. 

Depuis 2009, cette action se concentre sur quelques problématiques précises comme :
- La question de la place des ingénieurs du sud, leur formation et leur insertion dans le domaine de l’eau et de l’assainissement ;
- Les modèles de gestion de l’eau et le rôle des différents acteurs au Nord et au Sud ;
- Les pratiques de coopération et de partenariat et les mécanismes de dépendance entre le Nord et le Sud qu’elles engendrent.